בבחירת משאבה צנטריפוגלית חשוב לקבוע את נקודת העבודה של המערכת ולא לבחור משאבה רק לפי נתון הספיקה המרבית שלה. נקודת העבודה נקבעת מהמפגש בין עקומת המשאבה לעקומת המערכת וכוללת גובה סטטי, הפסדי לחץ בצנרת, שסתומים, מסננים ואביזרים. תנאי היניקה חשובים במיוחד. NPSH זמין שאינו מספיק עלול לגרום לקוויטציה, רעש, ירידה בספיקה ובלאי של האימפלר והמשאבה. משאבות צנטריפוגליות מתאימות בעיקר לנוזלים זורמים יחסית. ככל שהצמיגות עולה, הספיקה והיעילות יורדות וצריכת ההספק עולה. לנוזלים צמיגים מאוד או כאשר נדרשת ספיקה כמעט קבועה מול שינויי לחץ, משאבה נפחית עשויה להיות פתרון מתאים יותר.